1961년 10월 26일, 0세 때, 마누엘 에스티아르테는 스페인 카탈루냐 지방 만레사에서 출생했다.

1975년, 14세 때, 마누엘 에스티아르테는 CN 만레사에서 유소년 클럽 활동을 시작했다.

1979년, 18세 때, 마누엘 에스티아르테는 CN 바르셀로나 소속으로 활동했다.

1980년, 19세 때, 마누엘 에스티아르테는 모스크바 올림픽에 출전하여 득점왕에 올랐으며, 이를 통해 스페인 수구 국가대표로 데뷔했다.

1984년, 23세 때, 마누엘 에스티아르테는 LA 올림픽에 출전하여 득점왕에 올랐다.

1985년, 24세 때, 마누엘 에스티아르테는 수구 월드컵에서 동메달을 획득했다.

1986년, 25세 때, 마누엘 에스티아르테는 이탈리아의 팔라누오토 페스카라로 이적했다.

1988년, 27세 때, 마누엘 에스티아르테는 서울 올림픽에 출전하여 득점왕에 올랐다.

1989년, 28세 때, 마누엘 에스티아르테는 이탈리아의 라리 난테스 사보나 소속으로 활동했다.

1991년, 30세 때, 마누엘 에스티아르테는 세계 선수권 대회에서 은메달을 획득했다.

1991년, 30세 때, 마누엘 에스티아르테는 유럽 선수권 대회에서 은메달을 획득했다.

1991년, 30세 때, 마누엘 에스티아르테는 수구 월드컵에서 동메달을 획득했다.

1991년, 30세 때, 마누엘 에스티아르테는 CN 카탈루냐 소속으로 활동했다.

1992년, 31세 때, 마누엘 에스티아르테는 바르셀로나 올림픽에 출전하여 득점왕에 올랐다.

1993년, 32세 때, 마누엘 에스티아르테는 유럽 선수권 대회에서 동메달을 획득했다.

1994년, 33세 때, 마누엘 에스티아르테는 세계 선수권 대회에서 은메달을 획득했다.

1996년, 35세 때, 마누엘 에스티아르테는 아틀란타 올림픽에 출전하여 금메달을 획득했으며, 기존의 개인기 중심 플레이에서 팀 플레이 중심으로 스타일을 전환하여 팀에 기여했다.

1998년, 37세 때, 마누엘 에스티아르테는 수구 월드컵에서 금메달을 획득했다.

1998년, 37세 때, 마누엘 에스티아르테는 세계 선수권 대회에서 금메달을 획득했다.

1999년, 38세 때, 마누엘 에스티아르테는 수구 월드컵에서 동메달을 획득했다.

2000년, 39세 때, 마누엘 에스티아르테는 수구 선수로서 은퇴했다.

2000년, 39세 때, 마누엘 에스티아르테는 국제 올림픽 위원회(IOC) 선수 위원으로 취임했다.

2004년, 43세 때, 마누엘 에스티아르테는 국제 올림픽 위원회(IOC) 선수 위원으로서의 활동을 마쳤다.

2008년, 47세 때, 마누엘 에스티아르테는 펩 과르디올라가 이끄는 FC 바르셀로나의 선수 지원 담당 스태프(선수 지원 총괄 코치)로 합류하여 활동했다.

2012년, 51세 때, 마누엘 에스티아르테는 FC 바르셀로나에서의 스태프 활동을 마쳤다.

2013년, 52세 때, 마누엘 에스티아르테는 펩 과르디올라가 FC 바이에른 뮌헨 감독으로 부임하자 그를 따라 팀의 스태프로 합류했다.

2016년, 55세 때, 마누엘 에스티아르테는 FC 바이에른 뮌헨에서의 스태프 활동을 마쳤다.

2016년, 55세 때, 마누엘 에스티아르테는 펩 과르디올라를 따라 잉글랜드 축구팀 맨체스터 시티 FC의 스태프(선수 지원 총괄 코치 및 멘탈 코치)로 합류하여 현재까지 재직 중이다.